Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRIM4Q9C037 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRIM4Q9C037 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms