Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NLRP1Q9C000 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NLRP1Q9C000 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms