Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BRIP1Q9BX63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRIP1Q9BX63 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms