Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GATA5Q9BWX5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATA5Q9BWX5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms