Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSBP4Q9BWG4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms