Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM109Q9BVC6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM109Q9BVC6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms