Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EFHD1Q9BUP0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EFHD1Q9BUP0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms