Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MKNK1Q9BUB5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKNK1Q9BUB5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms