Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM42Q9BTD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RBM42Q9BTD8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM42Q9BTD8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms