Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBGCP2Q9BSJ2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP2Q9BSJ2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms