Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG101Q9BSB4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG101Q9BSB4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms