Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TXNDC17Q9BRA2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms