Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C20orf78Q9BR46 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C20orf78Q9BR46 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms