Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RTP3Q9BQQ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RTP3Q9BQQ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RTP3Q9BQQ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms