Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUSP9Q99956 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUSP9Q99956 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms