Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RBBP8Q99708 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RBBP8Q99708 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms