Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MEIS3Q99687 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MEIS3Q99687 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MEIS3Q99687 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms