Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD9AQ99638 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAD9AQ99638 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms