Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSPAN18Q96SJ8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSPAN18Q96SJ8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms