Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRPK1Q96SB4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRPK1Q96SB4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms