Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUDCD1Q96RS6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUDCD1Q96RS6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms