Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UIMC1Q96RL1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UIMC1Q96RL1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 483.5 ms