Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACCSQ96QU6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACCSQ96QU6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms