Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ODF3Q96PU9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3Q96PU9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms