Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RUNDC3BQ96NL0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RUNDC3BQ96NL0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms