Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF558Q96NG5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF558Q96NG5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms