Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CMTM3Q96MX0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM3Q96MX0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms