Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TIGD1Q96MW7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TIGD1Q96MW7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms