Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NSMCE2Q96MF7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NSMCE2Q96MF7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms