Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FGD4Q96M96 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD4Q96M96 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms