Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SAMD8Q96LT4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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SAMD8Q96LT4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SAMD8Q96LT4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SAMD8Q96LT4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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