Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00208Q96KT6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00208Q96KT6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms