Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERAC1Q96JX3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERAC1Q96JX3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms