Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMX3Q96JJ7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMX3Q96JJ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms