Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCC11Q96J66 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCC11Q96J66 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms