Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC51Q96ER9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC51Q96ER9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms