Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MRPL53Q96EL3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms