Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTERF3Q96E29 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTERF3Q96E29 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms