Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
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RCN3Q96D15 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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RCN3Q96D15 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RCN3Q96D15 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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