Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMARCE1Q969G3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMARCE1Q969G3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms