Protein–RNA interactions for Protein: Q92900

UPF1, Regulator of nonsense transcripts 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF1Q92900 MGAT1-210ENST00000506033 464 ntTSL 241.04■■■■■ 4.163e-7■■■■■ 28.5
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UPF1Q92900 MGAT1-222ENST00000513431 555 ntTSL 226.51■■□□□ 1.832e-10■■■■■ 28.5
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UPF1Q92900 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 28.5
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UPF1Q92900 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.213e-7■■■■■ 28.4
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UPF1Q92900 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 28.4
UPF1Q92900 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.388e-7■■■■■ 28.4
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UPF1Q92900 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.292e-9■■■■■ 28.4
UPF1Q92900 PREB-208ENST00000468045 3057 ntTSL 216.75■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 28.4
UPF1Q92900 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.582e-8■■■■■ 28.4
UPF1Q92900 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.973e-9■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.293e-9■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 ICMT-203ENST00000489498 2612 ntTSL 1 (best)17.85■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 TMEM184A-203ENST00000319018 4374 ntTSL 514.56□□□□□ -0.087e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.092e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.762e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.572e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.647e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.367e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.367e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 RSAD1-204ENST00000506211 930 ntTSL 322.44■■□□□ 1.187e-7■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.246e-8■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.815e-8■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.685e-8■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.35e-8■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 CASP8-201ENST00000264274 2540 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.681e-12■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 CASP8-205ENST00000358485 2930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-12■■■■■ 28.3
UPF1Q92900 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-12■■■■■ 28.3
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