Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA4DQ92854 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEMA4DQ92854 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms