Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EDEM1Q92611 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDEM1Q92611 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDEM1Q92611 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms