Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMPDL3AQ92484 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMPDL3AQ92484 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms