Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY2Q8WXA3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms