Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF31Q8WWY3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF31Q8WWY3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms