Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C9orf43Q8TAL5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C9orf43Q8TAL5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms