Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATL2Q8NHH9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATL2Q8NHH9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms