Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZD8Q8NEN9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDZD8Q8NEN9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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