Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC89Q8N998 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms